Molekulárna ekológia je novým biologickým odvetvím, ktoré aplikuje metódy molekulárnej a populačnej genetiky a evolučnej biológie pri odpovediach na základné ekologické otázky. V prvej časti knihy sú opísané základné termíny a metódy, ako sú napríklad polymerázová reťazová reakcia (PCR), DNA sekvenovanie, mutácie, molekulárne markery a iné. Poznanie základných metód je nevyhnutné pre pochopenie druhej časti knihy, kde sú uvedené praktické využitia týchto metód v ekológii, fylogeografii, v ekológii správania a v ochrane prírody.
Molecular ecology is a new field of biology that applies molecular genetics, population genetics and evolutionary biology to answer basic ecological questions. In the first part of the book basic terms and methods, such as polymerase chain reaction (PCR), DNA sequencing, mutations, molecular markers and etc. are described. Knowledge of these basic methods are necessary for understanding of the second part of the book. There is described the practical usage of these methods for ecology, phylogeography, behavioral ecology and for conservation.
Obsah:
1. Introduction in molecular ecology/ Úvod do molekulovej ekológie 4
2.Basis terms used in molecular ecology/ Základné pojmy používané v molekulovej ekológii 8
3.Proteins/ Bielkoviny 10
3.1. Structure of proteins/ Štruktúra bielkovín 10
3.2. Biological functions of proteins/ Biologické funkcie bielkovín 14
4.Nucleic acid/ Nukleové kyseliny 16
4.1. Deoxyribonucleic acid (DNA)/ Deoxyribonukleová kyselina (DNA) 18
4.2. Ribonucleic acid (RNA)/ Ribonukleová kyselina (RNA) 24
5.Dna replication/ Replikácia dna 28
6.Genetic code/ Genetický kód 32
6.1. Gene expression/ Expresia génu 34
7.Processes of genetic information transfer/ Procesy prenosu genetickej informácie 38
8.Mutation and recombination/ Mutácie a rekombinácia 44
8.1. Importance of mutations/ Význam mutácií 44
8.2. Classification of mutation/ Klasifikácia mutácií 46
8.3. Recombination/ Rekombinácia 50
9.Polymerase chain reaction/ Polymerázová reťazová reakcia 54
9.1. Components and the process of PCR/ Zložky a proces PCR 54
9.2. Primers in PCR/ Primery v PCR 60
9.3. Some modifications of PCR/ Niektoré modifikácie PCR 60
9.4. Sources of DNA for PCR/ Zdroje DNA pre PCR 64
9.5. Ways to determinate of PCR products/ Spôsoby determinácie PCR produktov 64
9.6. DNA sequencing/ Sekvenovanie DNA 66
10. Genetic manipulations, genetic modified organisms/ Genetické manipulácie, geneticky modifikované organizmy 68
10.1. Genetically modified organisms/ Geneticky modifikované organizmy 68
11. Molecular markers/ Molekulárne markery 72
11.1. Co-dominant markers/ Kodominantné markery 72
11.2. Dominant markers/ Dominantné markery 78
12. Genetic analysis of single populations/ Genetická analýza jednotlivých populácií 84
12.1. Quantifying genetic diversity/ Kvantifikácia genetickej diverzity 84
12.2. Factors influencing genetic diversity/ Faktory ovplyvňujúce genetickú diverzitu 88
13. Genetic analysis of multiple populations/ Genetická analýza viacerých populácií 100
13.1. Genetic distance/ Genetická vzdialenosť 100
13.2. Gene flow/ Tok génov 100
14. Phylogeography/ Fylogeografia 106
14.1. Molecular clocks/ Molekulárne hodiny 106
14.2. Distribution of genetic lineages/ Distribúcia genetických 108
14.3. Hybridization/ Hybridizácia 110
15. Behavioural ecology/ Ekológia správania 114
15.1. Social breeding/ Sociálna výchova 114
15.2. Manipulation of sex ratio/ Ovplyvňovanie pomeru pohlaví 116
15.3. Sex-determination system/ Determinácia pohlavia 118
16. Conservation genetics/ Starostlivosť o zachovanie genetickej rozmanitosti 124
16.1. DNA barcoding/ Čítanie genetického čiarového kódu DNA (barcode DNA) 126
16.2. Population size, genetic diversity and inbreeding/ Veľkosť populácie, genetická diverzita a inbríding 126
17. Application of molecular ecology/ Aplikácia molekulovej ekológie 134
17.1. Poaching/ Pytliactvo 134
17.2. Identifying prey/ Identifikácia koristi 134
17.3. Illegal trade/ Nelegálny obchod 136
17.4. Agriculture/ Poľnohospodárstvo 136
18. References/ Literatúra 140
